Détenu par les Martiens, Koga fait la connaissance de Haruto, un Chevalier qui est également ninja et connaît aussi les véritables desseins de Ionia, le directeur. Mars a, en effet, promis au directeur le rôle de Pope s'il collaborait avec lui. Il a trahi la véritable Athéna. Koga et Haruto parviennent à s'échapper, alors que la Palestre n'est plus qu'une immense prison de ténèbres. Là, les élèves se rebellent contre l'autorité des oppresseurs. La bataille commence...