Alors qu'ils enquêtent sur un nouveau mystère, Scooby et ses amis tombent sur une autre équipe qui résout des mystères, les Funky Phantom. Mais au lieu de collaborer, ils n'arrêtent pas de se chamailler et l'enquête stagne... Scooby et ses amis font le tour des endroits hantés d'Angleterre lorsqu'ils tombent sur les crânes hurlants de Londres. En essayant de leur échapper, ils tombent sur Sherlock Holmes... Le Scooby-Gang est de retour pour une saison pleine d'aventures. Cette fois, ils ont affaire à des mystères qu'ils doivent résoudre. Ils sont également aidés par Wonder Woman, Sherlock Holmes et un tas d'autres personnages célèbres.