Steve et Danny sortent de l'hôpital et reprennent le travail : une enquête pour meurtre les attend. Petite particularité : le corps de la victime a été découvert dans les locaux du 5-0. Plus tard, les agents collaborent avec un membre du MI-6 afin de traquer un terroriste qui a déjà sévi contre l'ambassade britannique à Madrid. A peine l'affaire résolue, McGarrett et Alicia deviennent les proies d'un tueur en série, qui n'a pas hésité à les enlever. Le reste de l'équipe tente l'impossible pour les sortir de ce mauvais pas. Une 7e saison marquée par de multiples rebondissements et la participation de Lou Diamond Phillips ("La Bamba") en invité de l'épisode 14. Une amie de Jerry, théoricienne du complot comme lui, se fait abattre sous ses yeux par un sniper alors qu'elle venait de le retrouver à Hawaii. Elle était sur le point de prouver que les membres de l'administration Kennedy auraient secrètement organisé l'assassinat du président depuis Hawaii en novembre 1963. Tandis que Jerry poursuit les investigations menées par son amie, McGarrett et Danny se lancent à la recherche du meurtrier. Avec cette nouvelle enquête, l'équipe est replongée dans l'un des mystères les plus fascinants de l'Histoire...