Toutes les 30 secondes, une personne disparaît aux Etats-Unis. A New York, une section spéciale du FBI, dirigée par Jack Malone, un ancien soldat, dresse le portrait psychologique de ces disparus, et recoupe les témoignages de leurs proches pour déterminer si cette disparition est volontaire, accidentelle ou criminelle. A l'orée de cette première saison, l'équipe accueille un nouvel agent spécial, Martin Fitzgerald, qui vient compléter l'équipe formée par Jack Malone, Vivian, Samantha et Danny. Aux Etats-Unis, la diffusion de chaque épisode était accompagnée d'un avis de disparition réel. Jack Malone, du service des personnes disparues, et son équipe recherchent Patrick Kent, un homme d'affaires new-yorkais qui a disparu à San Diego, alors qu'il s'apprêtait à effectuer un voyage en avion. Bien qu'il ait enregistré ses bagages à l'aéroport et reçu sa carte d'embarquement, l'homme n'est jamais monté à bord. La dernière personne à l'avoir vu est le barman de l'aéroport. Les agents épluchent et consignent le moindre des faits et gestes de la victime, survenus durant les heures précédant sa disparition. Ils découvrent que Kent menait une double vie. Son beau-père, Noah Ridder, le faisait surveiller par un détective privé...