Au tout début des années 1990, à Miami, Dexter Morgan, un étudiant torturé, est tenaillé par le désir de tuer. Lorsque ses pulsions sanguinaires sont trop fortes, il trouve réconfort et compréhension auprès de son père adoptif, Harry, qui tente de le canaliser en lui enseignant quelques règles. Il lui suggère notamment de n'éliminer que des personnes qui méritent de mourir, comme des criminels qui ont échappé au système judiciaire. Dexter se plie à ces règles tout en faisant ses débuts dans le département de médecine légale de la police de Miami. Aux cotés de Patrick Gibson, qui reprend le personnage iconique créé par Michael C. Hall, on retrouve Sarah Michelle Gellar et Christian Slater, impressionnant dans le rôle du mentor ambigu du tueur. Après un raid du SWAT qui a mal tourné, Dexter se rapproche de l'auteur du rapt de l'enfant. Pendant ce temps, Deb travaille avec son père et voit la police de Miami sous un nouveau jour. Harry s'intéresse de plus près à l'affaire du tueur en série mais cache sa théorie à LaGuerta...