Quand Captain Atomic, le super héros préféré de Joey, se retrouve métamorphosé en marionnette dont les super pouvoirs ne peuvent être activés que par le poing de Joey, le jeune garçon voit ses rêves se réaliser ou presque. Atomic Puppet veut toujours sauver le monde, mais de préférence en solo. Ensemble, ils composent un duo comique et maladroit qui cherche à s'imposer comme la meilleure équipe de super héros de la ville.