Fred, Véra, Daphné, Sammy et Scooby-Doo enquêtent sur des grands mystères. Au programme de cette première saison, la bande est confrontée à plusieurs événements étranges : un homme-crabe, une ville fantôme peuplée par des crocodiles et un gnome. Un homme-crabe attaque la plage de Crystal Cove lors d'un tournoi de volley-ball organisé pour la boisson Trickell Triquid. La bande doit l'arrêter et résoudre ce mystère avant que les joueuses du tournoi, dont l'homme-crabe a prit goût, soient mises en danger...