L'entrepôt 13 a été entièrement détruit par la bombe de Walter Sykes. Frederic est morte, mais Artie, Myka et Pete ont survécu. Sans le vouloir, Artie révèle son secret à Leena. Il finit par en évoquer une partie avec Claudia et Steve. Une terrible épidémie menace l'humanité. Laura Innes, Lindsay Wagner, Sam Huntington, Kate Mulgrew, Joel Grey ou encore Brent Spiner font partie des guest stars de cette quatrième saison. Alors que Claudia rencontre madame Frederic pour discuter de son avenir en tant que gardienne de l'Entrepôt, Artie et Steve enquêtent sur les vols qui y ont eu lieu. De leur côté, Pete et Myka partent à l'étranger pour en savoir plus sur un joueur de hockey qui guérit miraculeusement. Y a-t-il un artefact derrière tout cela ?