Alors qu'il coupe l'énergie de certains systèmes d'Atlantis, McKay est frappé par un rayon émis par un mystérieux appareil. Il s'aperçoit alors qu'il détient des super pouvoirs. Mais sa joie est de courte durée : les effets de sa mutation pourraient être mortels. L'équipe doit trouver un moyen pour sauver McKay avant qu'il ne soit trop tard...