Un véhicule transportant des dossiers diplomatiques pouvant compromettre la sécurité nationale a été attaqué. L'équipe du NCIS doit déterminer qui sont les auteurs du crime ainsi que ce qui a disparu du véhicule lors du méfait. Elle découvre rapidement que le paquet dérobé n'a aucune valeur. Les agents s'interrogent sur l'implication du superviseur et d'éventuelles complicités. Eric et Nell recherchent un fourgon, tandis que Kensi et Deeks remontent une piste liée à des trafics de médicaments. Ils découvrent tout le réseau de contrebandiers. Durant ce temps, Callen et Sam décident de célébrer leurs cinq années de collaboration...