La fusillade dont a été victime toute l'équipe à l'issue de la saison précédente laisse Danny dans un fauteuil roulant. La rééducation s'avère lente et douloureuse. L'équipe des "Experts" de Miami vient prêter main forte à Mac à New York, dans une affaire qui se termine à Las Vegas. Mac est assailli de souvenirs de son père. Flack, très perturbé, est victime d'une agression dans le métro. Quant à Sheldon, coincé dans une prison en plein chaos, il découvre l'identité du meurtrier de sa soeur. Une saison bouleversante à plus d'un titre pour tous les personnages. Melina Kanakaredes, qui interprète le rôle de Stella, quitte la série à l'issue de cette saison.