La décision du président des Etats-Unis vient de tomber. Le projet Stargate doit prendre fin et la base doit être vidée de son équipement. La Porte des étoiles doit rester inactive, et quiconque essaiera de la franchir sera traduit en cour martiale. SG-1, persuadée que les Goa'ulds vont bientôt attaquer, utilisent la Porte pour se rendre là où Apophis a massé ses troupes. Ils se retrouvent sur un vaisseau d'attaque qui se dirige vers la Terre en voyageant plus vite que la lumière. Skaara, devenu Klorel, fils d'Apophis, en est le commandant. O'Neill essaie de pousser Skaara à prendre le dessus sur la larve goa'uld qui manipule son esprit...