La Naval Criminal Investigative Service, plus connue sous le nom de NCIS, est une unité spéciale chargée d'enquêter sur toutes les affaires criminelles liées à l'US Navy. Ainsi, lorsqu'un officier commandant de marine est retrouvé mort, Leroy Jethro Gibbs, Tony DiNozzo et Ducky Mallard, les agents spéciaux de l'équipe d'intervention du NCIS, se rendent immédiatement à l'endroit où a été constaté le décès pour tenter de savoir si la mort de l'officier est naturelle ou non. Mais cela ne semble pas plaire à TC Fornell, l'agent du FBI également chargé des investigations sur cette mort suspecte...