Trois mois après avoir été piégée par Christopher Pelant, Bones, teinte en blonde, est toujours en fuite avec son père et sa fille Christine, pendant que Booth et Angela poursuivent leurs efforts afin de l'innocenter. Ils tentent de découvrir comment l'homme, usant de tout son génie informatique, a fait pour insérer la silhouette de Brennan sur la vidéo de sécurité montrant les images du meurtre de Sawyer. La légiste conduit l'équipe de l'Institut Jefferson en Virginie, dans la ville natale du tueur, vers un squelette qu'elle a elle-même déterré. La victime pourrait bien être un conseiller scolaire ayant joué un rôle clef dans l'orientation de Pelant. Pendant ce temps, Booth fait tout son possible pour retarder l'agent spécial chargé d'arrêter Bones...