L'enquête porte sur plusieurs mystères : des sarcophages égyptiens sont soudainement tachés d'une substance inconnue et des livres médiévaux sont maculés d'encre par l'Inquisition espagnole pour censurer certains passages. Le récit s'intéresse aussi au vol étrange d'un tableau de Goya, restitué quatre ans plus tard, et à un artefact du XVIIe siècle, la première calculatrice, créé pour prédire la fin du monde.