Au cours d'une enquête sur des terroristes proches d'Al-Qaida, Gibbs est sérieusement blessé dans une violente explosion. Il est aussitôt emmené à l'hôpital, où un passé douloureux, qu'il a toujours dissimulé à son entourage, ressurgit brutalement. La douleur lui rappelle les blessures reçues à la fin de la guerre du Golfe, quinze ans plus tôt. Les autres doivent poursuivre la mission sans lui. L'ambiance est d'autant plus lourde au sein de l'équipe que certains estiment que Tony est responsable de ce qui est arrivé à Gibbs. Tony se sent sur la sellette. Il craint que cette mission ne soit sa dernière au sein du NCIS...