Abby est réquisitionnée par l'armée pour travailler sur un projet ultra-secret. Gibbs et son équipe, en pleine enquête sur un meurtre, doivent donc se passer de ses services. Gibbs découvre alors qu'Abby a été sélectionnée en remplacement de Philip Heller, un scientifique militaire qui est porté disparu. Il comprend également que le crime sur lequel il travaille, celui de Marco Riggs, est peut-être lié au projet auquel participe Abby. En effet, Marco Riggs a visiblement été engagé pour assassiner Philip Heller, lequel s'en est sorti en le tuant avec un pistolet électrique. Gibbs est convaincu que les études sur l'ADN menées par l'armée n'ont pas seulement pour but de soigner des soldats malades...