Zack Addy enlève Brennan pour lui faire comprendre qu'il n'a jamais tué personne. Il se montre convaincant car Bones accepte de l'aider à se disculper. Alors que Bones célèbre ses 40 ans, Daisy obtient son doctorat et Angela une récompense inattendue. Booth, lui, est plus inquiet. Un meurtre sur lequel il enquête semble lié à Mark Kovac, un tueur en série, qui est aussi son pire ennemi. Une dernière saison pleine de rebondissements pour l'une des séries les plus attachantes de ces dernières années, en grande partie grâce à son sympathique duo d'acteurs. Après des années d'internement dans un hôpital psychiatrique, Zack Addy, l'ancien interne de Bones à l'institut Jefferson, est relâché et en profite pour kidnapper son mentor. Il cherche à la convaincre, malgré les preuves à charge contre lui, qu'il n'est pas un tueur en série. Mais Booth, qui connaît bien son mode opératoire, finit par les retrouver. Zack clame son innocence, et il pourrait dire vrai. En effet, le corps sectionné d'une nouvelle victime âgée de 20 ans vient d'être retrouvé. Quant au "Marionnettiste", il est apparemment toujours dans la nature. Zack est-il l'auteur des crimes dont on l'accuse ?