L'entrepôt 13 a été entièrement détruit par la bombe de Walter Sykes. Frederic est morte, mais Artie, Myka et Pete ont survécu. Sans le vouloir, Artie révèle son secret à Leena. Il finit par en évoquer une partie avec Claudia et Steve. Une terrible épidémie menace l'humanité. Laura Innes, Lindsay Wagner, Sam Huntington, Kate Mulgrew, Joel Grey ou encore Brent Spiner font partie des guest stars de cette quatrième saison. Steve est sauvé par Claudia et réintègre l'équipe. Pete et Myka sont envoyés à Devils Lake afin de retrouver un artefact de Walter Sykes...