Cela fait cinq jours que Jack O'Neill assume le commandement du SGC. Il doit faire face à de multiples problèmes. En premier lieu, s'occuper d'une plante mystérieuse, rapportée d'une mission, et dont la croissance exponentielle ne peut être stoppée. Puis la capture de Sam, Daniel et Teal'c par Ba'al et des rebelles Jaffa. Enfin, il lui faut organiser des négociations entre divers émissaires de l'Alliance, tractations menacées par la traîtrise d'un seigneur déloyal. Un générateur, datant des Anciens, pourrait peut-être servir à débloquer une situation qui apparaît pour l'heure sans issue...