Lysandre continue à menacer le monde, mais nos héros se sont séparés et luttent sur tous les fronts ! Sacha et Alain affrontent Lysandre, tandis que Malva se range à leurs côtés. Pendant ce temps, Clem affronte le Zygarde menaçant, en chantant courageusement sa chanson à Pouic, à travers ses larmes...